Fundatia Moldova a fost inregistrata in 2003 in statul Virginia, SUA, si si-a inceput activitate in vara anului 2004 prin initierea elaborarii strategiei 3-D (decriminalizare, demilitarizare, democratizare) pentru solutionarea conflictului Transnistrian, creata in baza principiilor 3-D formulate de societatea civila din Republica Moldova.
Incepand cu 2004, Fundatia Moldova implementeaza programul de advocacy la Washington cu scopul atentionarii opiniei publice si a organelor statale americane, misiunilor diplomatice straine acreditate in SUA despre problemele cu care se confrunta Republica Moldova in vederea obtinerii suportului in depasirea lor.
In afara de conferintele si seminarele organizate la Washington si Brussels, Fundatia Moldova a initiat crearea unui grup de lucru (neguvernamental) la Washington axat pe problemele Moldovei si in care au fost incluse personalitati influente din estableshmentul american, inclusiv fosti ambasadori americani in Republica Moldova, sefi de departamente de la institutii de cercetare din Washington (CSIS, Open Society Institute, IRI, NDI, NED, Project on Transitional Democracies, Jamestown Foundation, Universitatea Georgetown, Universitatea Johns Hopkins, etc.), precum si experti independenti ce cunosc situatia din Republica Moldova.
Fundatia sponsorizeaza cel mai popular portal despre Moldova -- Moldova.org.
Principalele teme care au fost abordate in cadrul conferintelor, seminarelor, sedintelor grupului de lucru sunt solutionarea problemelor de securitate regionala – conflictul transnistrian si retragerea trupelor Federatiei Ruse din Republica Moldova – precum si asistenta in consolidarea democratiei in Republica Moldova.
Fundatia Moldova este condusa de un consiliu director (board-ul) compus din personalitati americane, europene si din alte tari. Consiliu aproba directiile de activitate, iar managementul operativ este infaptuit de catre presedintele fundatiei care este asistat de o echipa de voluntari in organizarea conferintelor, seminarelor si intrunirile grupului de lucru pe Moldova la Washington.